中國科學(xué)院成都生物研究所兩棲爬行動(dòng)物、植物標本館
成都生物所兩棲爬行動(dòng)物、植物標本館是在該所原植物標本館（建于1958年）和兩棲爬行動(dòng)物標本館（建于1965年）的基礎上合并而成，是集科研、標本保藏、展覽、學(xué)術(shù)交流等功能為一體的具有國內先進(jìn)水平的標本館，在兩棲爬行動(dòng)物分類(lèi)、系統演化方面的研究達到亞洲領(lǐng)先水平。
中國科學(xué)院植物研究所植物標本館
亞洲最大的植物標本館，目前館藏臘葉標本愈220萬(wàn)號，并妥善保藏了1萬(wàn)余份模式標本。還有8萬(wàn)號種子標本和7萬(wàn)號化石植物標本。
中國科學(xué)院微生物研究所菌物標本館
目前保藏標本40多萬(wàn)號，其中已定名標本為19萬(wàn)號，2萬(wàn)余種，已定名標本采自中國以及111個(gè)國家，南極大陸和北極圈內地區。
中國科學(xué)院武漢病毒研究所中國病毒標本館
中國科學(xué)院武漢病毒研究所創(chuàng )建了具有現代化展示手段的我國唯一的“中國病毒標本館”，集學(xué)科性、特色性和科普性于一體，是第一批“全國青少年走進(jìn)科學(xué)世界科技活動(dòng)示范基地”。
中國科學(xué)院武漢植物園標本館
始建于1956年，主要收藏湖北及華中地區植物標本。現館藏模式標本約200份，蕨類(lèi)植物標本5100份，裸子植物標本2700余份，被子植物標本191500份。
中國科學(xué)院華南植物園標本館
收集積累了維管束植物標本超過(guò)100萬(wàn)號，其中有種子植物85萬(wàn)號、苔蘚植物4萬(wàn)號、蕨類(lèi)植物4萬(wàn)號、模式標本近7000號、復份標本8萬(wàn)號，液浸標本6400號，使標本館得到長(cháng)足發(fā)展，成為全國三大植物標本館之一。
中國科學(xué)院昆明植物研究所標本館
標本館現收藏植物標本110.0萬(wàn)份，是國內收藏植物類(lèi)群較全（涵蓋除藻類(lèi)以外的所有植物門(mén)類(lèi)）的標本館，收藏的植物標本來(lái)自全國，尤以西南及東喜馬拉雅地區的最為豐富。本館在中國乃至世界植物學(xué)研究、資源的開(kāi)發(fā)利用及生物多樣性保護方面具有重要的地位，是中國植物學(xué)研究的重要基地。
中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園熱帶植物標本館
標本館是西雙版納熱帶植物園科研系統中技術(shù)支撐機構之一，對本園學(xué)科發(fā)展提供技術(shù)支撐服務(wù)，同時(shí)也為地方林業(yè)，環(huán)保，園林，海關(guān)，公安和科普等社會(huì )事業(yè)提供技術(shù)服務(wù)。
共存儲裝訂標本125013份。其中被子植物標本111137份，裸子植物標本700份，蕨類(lèi)植物標本13158份，苔蘚植物標本18份，國內標本117606份，絕大部分為本館在滇南地區采集；國外標本有7407份，主要通過(guò)與泰國，越南，柬埔寨等東南亞國家的國際合作項目及標本交換獲得。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所青藏高原生物標本館
標本館作為目前收藏、保存青藏高原這一特殊區域的生物標本數量最多、種類(lèi)最全、館藏最豐富的標本館，其獨有的青藏高原特色，在全國乃至世界范圍內都是無(wú)可替代的。
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